Alfa ceto glutamidas (AKG) como posibles inhibidores de la proteasa del Coronavirus COVID-19.

Mírenlo bien: esta estructura es la proteína S del COVID19 y puede ser la molécula que nos permita encontrar un fármaco que pueda tratar al COVID19.

https://youtu.be/cCwjLAR-0pk

La actual pandemia del   beta coronavirus de Wuhan ( COVID-19) está mediada por un virus RNA  monocatenario, de tamaño 50-200 nanometros, con una serie de  azúcares en la cubierta externa lo que le hace ser  "relativamente pesado". Parece ser que la vida media del virus en  aerosol es de  66 minutos, y que al cabod e las tres horas  se deporita en el suelo.   Esto es muy arreisgado y  las  declaraciones de una portavoz de la OMS , la Dra Maria van Kerkhouve diciendo que no hace falta  mascarillas porque no es una transmisión "airborne" nos parecen UNA TEMERIDAD. 

El virus COVIS-19 es MUY contagioso con una R0 = 2,7, muy superior a  los ortomixovirus de la "gripe vulgar" que  es  de R0=1,3.

Aunque les cueste creerlo, se puede patentar la secuencia de ARN de un virus, que aunque parezca natural ( o no, y es una arma biolñógica) no deja de ser un sisnsentido patentarlo como si fuera un dentífrico. Los virus SARS y MERS fueron patentados, como atestigua: 

https://patentimages.storage.googleapis.com/6b/c3/21/a62eb55a0e678c/US7220852.pdf y MERS-CoV (MERS) https://data.epo.org/publication-server/pdf-document?pn=2898067&ki=B1&cc=EP&pd=20200115 

En sólamente dos meses  el COVID-19 está siendo exhaustivamente estudiado:  por la encuesta epidemiológica se supone que es infectante en la fase asintomática ( de 2 a 14 días, con una media de 5 días) y también en las dos semanas posteriores  a la "curación· de la enfermedad.

En la superficie del virus nos encontramos  las proteínas S ( con dos subunidades S1 y S2) , y la proteína  M .

El ARN monocatenario del COVID-19 codifica la poliproteína 

ORF1b que se escinde en varias proteínas relevantes en su replicación.

 Una de ellas es la polimerasa de ARN dependiente de ARN, llamada RdRp, o nsp12, clave en la catálisis de la síntesis del ARN del virus y diana de fármacos antivirales como remdesivir y sofosbuvir. 

Se acaba de publicar en bioRxiv la estructura tridimensional del complejo proteico nsp12-nsp7-nsp8; se ha obtenido por criomicroscopia electrónica (cryo-EM) con una resolución de 2.9 Å. Además de ayudar a entender cómo actúan remdesivir y sofosbuvir, se espera que permita desarrollar nuevos antivirales específicos 

Yan Gao, Liming Yan, …, Zihe Rao, «Structure of RNA-dependent RNA polymerase from 2019-nCoV, a major antiviral drug target,» bioRxiv preprint (16 Mar 2020), doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.16.993386. Seguro que se publicará en Nature Communications, como ya lo hizo el artículo sobre SARS-CoV, Robert N. Kirchdoerfer, Andrew B. Ward, «Structure of the SARS-CoV nsp12 polymerase bound to nsp7 and nsp8 co-factors,» Nature Communications 10: 2342 (28 May 2019), doi: https://doi.org/10.1038/s41467-019-10280-3.

La estructura 3D del complejo proteico nsp12-nsp7-nsp8 del coronavirus humano SARS-CoV se publicó en Nature Communications en 2019. Comparte muchas semejanzas (estructuras conservadas) con la de SARS-CoV-2 (antes llamado 2019-nCoV). Pero las pocas diferencias son claves para el desarrollo de antivirales específicos contra COVID-19. Esta figura muestra las diferencias entre las secuencias de aminoácidos de la proteína nsp12 del nuevo coronavirus humano SARS-CoV-2 (2019-nCoV en la figura), el coronavirus humano SARS-CoV y el coronavirus de murciélagos RaTG13. Parecen pocas diferencias, pero son suficientes para que los antivirales más eficaces contra SARS no sean los más eficaces contra COVID-19.

La estructura tridimensional a escala atómica de la proteína nsp12 permite estudiar con todo lujo de detalles su interacción con antivirales. 

El fármaco que  más posibilidades tiene de ser útil es el Remdesivir, del laboratorio americano  Gilead, que se va a estudiar en el Ensayo Clínico "Solidaruty" de la OMS.s

Fuentes: (Manli Wang, Ruiyuan Cao, …, Gengfu Xiao, «Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro,» Cell Research 30: 269-271 (04 Feb 2020), doi: https://doi.org/10.1038/s41422-020-0282-0; Michelle L. Holshue, Chas DeBolt, …, Satish K. Pillai, «First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States,» The New England Journal of Medicine (NEJM) 382:929-936 (05 Mar 2020), doi: https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001191).

y tres tipos de proteínas,  la proteína Espikulada ( Spike proteín) ,que es tiene una estructura conformacional representada en el video que tienen abajo.

 Esta proteína S está compuesta por dos  subunidades , S1:encargada del ANCLAJE del virus; 

y S2, que es la que se encarga de la FUSION y posterior  introducción a la  célula del pulmón, uniéndose al receptor ACE/2..

ésta proteína S  ha sido secuenciada y su estructura está mostrada abajo:

formando parte del genoma del virus y tiene entre 1120 y 1200 kdalton. 

En la zona  de líneas discontínuas de abajo

Es la forma mediante la cual el virus se une a un receptor ACE/2 (  angiotensina y el receptor RBD del COVID-19. 

 Este  receptor es más abundante  en las células epiteliales de pulmón y , que vemos estructuralmente  aquí abajo por microscopía crioelectrónica. Esta técnica fue premiada con el premio Nobeld e medicina, hace dos años.:

Si ampliamos un poco más la imagen , vemos como ése receptor  va a ser  menos abundante en niños, por debajod e 16 años, quizás por eso es por lo  que hay menos casos en  infantes. Al parecer sólo ha habido  muy pcos casos  y quizás ea porque en  esas edades tempranas de la vida el sistema ACe/2 de la angiotensina está muy inmduro. Hay pocos niños afortunadamente con hipertensión renal por exceso de angiotensina.

la unión específica parece ser que es con un residuo de furina , tal como aparece en las imagen abajo:

O más aumentada la imagen: 

Otra de las estrategias de ataque sería la presencia de una MPro, o proteasa que está igualmente en la superficie del virus y tiene ésta estructura:

Esta proteasa se ha visto que es inhibida por una serie de sustancias que se llaman AKG, inhibidores del alfa Ceto glutamida, que son  pro fármacos activados por peróxidod e hidrógeno, con la estructura básica:

cuya estructura química tenemos abajo: son los compuestos experimentales 13 a,13 b y 11 r.

Estructura química de los inhibidores de la alfa cetoglutamida ( AKG) , denominados compuesto 11r, 13 a y 13 b.


Estas sustancias inhiben la proteasa del  COVID-19.tal como queda reflejado en l a siguiente imagen, que es  la unión específica  al compuesto 13 b.:se produce un ataque nucleofílico de la cys en el grupo cetónico y se forma un tio hemi ketal, en reacción reversible, lo que se sabe por la densidad electrónica de ésta  molécula quiral

El grupo oxidrilo de éste tio hemi ketal se estabiliza por enlaces de puentes de hidrógeno desde la cadena de amidas de los aminoácidos  Cisteína y Glicina (y parcialmente serina) 

el RESTO DE LA EXPLICACIÓN es un manual de química farmacéutica que es una delicia  no truducir y leerlo directamente del ingles: 

 S1 pocket of the protease, where the lactam amide nitrogen donates a three-center (bifurcated) hydrogen bond to the main-chain oxygen of Phe140 (3.20/3.10/3.28 Å; values for the structure in space group C2/space group P212121 molecule A/space group P212121 molecule B) and to the Glu166 carboxylate (3.35/3.33/ - Å), and the carbonyl oxygen accepts a 2.57/2.51/2.81-Å H-bond from the imidazole of His163. The P2 cyclopropyl methyl moiety is embraced by the S2 subsite, which has shrunk by 28.4 Å3 compared to a complex between compound 13a with P2 = cyclohexyl methyl and the SARS-CoV Mpro (LLZ et al., unpublished). The pyridone in the P3 position of the inhibitor occupies the space normally filled by the substrate’s main chain, its carbonyl oxygen accepts a 2.89/2.99/3.00-Å hydrogen bond from the main-chain amide of residue Glu166. Further, the P3 amide donates a 2.83/2.96/2.87-Å H-bond to the main-chain oxygen of Glu166. Embedded within the pyridone, the P2 nitrogen can no longer donate a hydrogen bond to the protein; however, our previous crystal structures showed that the P2 main-chain amide of the linear α-ketoamides does not make a hydrogen bond with the protein in all cases, so this interaction does not seem to be essential (Zhang et al., 2020). The Boc group does not occupy the canonical S4 site of the protease, but is located near Pro168 (at a distance of 3.81/4.17/3.65 Å); due to this interaction, the latter residue is “pushed” by >2 Å (compared to the structure of the free enzyme). This contact explains that removing the Boc group weakens the inhibitory potency of this compound by a factor of about 2. Interestingly, there is a space between the pyridone ring of 13b, the main chain of residue Thr190, and the side-chain of Gln189, which is filled by a DMSO molecule in the C2 crystal structure and a water molecule in the P212121 structure. This suggests that P3 moieties more bulky than pyridone may be accepted here.

Compound 13b inhibits the purified recombinant 2019-nCoV Mpro with IC50 = 0.67 ± 0.18 μM. The corresponding IC50 values for inhibition of the SARS-CoV Mpro and the MERS-CoV Mpro are 0.9 ± 0.29 μM and 0.58 ± 0.22 μM, respectively. In a SARS-CoV replicon (Kusov et al., 2015), RNA replication is inhibited with EC50 = 1.75 ± 0.25 μM. In human Calu3 cells infected with MERS-CoV, the compound showed excellent antiviral activity (Lucie Sauerhering & Stephan Becker personal communication).

As the next steps in the development of compound 13b towards a potential drug targeting 2019-nCoV or other coronaviruses, we will undertake tests in virus-infected cell cultures and in a small-animal model (once it will become available for 2019-nCoV). Meanwhile, our crystal structures may be used by others for virtual screening and de-novo design of inhibitors.

Medicina china y otros fármacos usados contra COVID-19.

Abstract

As of January 22, 2020, a total of 571 cases of the 2019-new coronavirus (2019-nCoV) have been reported in 25 provinces (districts and cities) in China. At present, there is no vaccine or antiviral treatment for human and animal coronavirus, so that identifying the drug treatment options as soon as possible is critical for the response to the 2019-nCoV outbreak. Three general methods, which include existing broad-spectrum antiviral drugs using standard assays, screening of a chemical library containing many existing compounds or databases, and the redevelopment of new specific drugs based on the genome and biophysical understanding of individual coronaviruses, are used to discover the potential antiviral treatment of human pathogen coronavirus. Lopinavir /Ritonavir, Nucleoside analogues, Neuraminidase inhibitors, Remdesivir, peptide (EK1), abidol, RNA synthesis inhibitors (such as TDF, 3TC), anti-inflammatory drugs (such as hormones and other molecules), Chinese traditional medicine, such ShuFengJieDu Capsules and Lianhuaqingwen Capsule, could be the drug treatment options for 2019-nCoV. However, the efficacy and safety of these drugs for 2019- nCoV still need to be further confirmed by clinical experiments.

De dónde procede el COVID-19?

¿ De dónde procede el COVID-19?

  

¿ De dónde viene el COVID-19?

Los autores de éste artículo, publicado en Nature  https://doi.org/10.1038/s41591-020-0820-9 indican  que, que “es improbable que el origen del virus (SARS-CoV2 =COVID-19)  sea a través de manipulación genética de otro de los siete coronavirus ya existentes.

Se basan en decir ésta importante conclusión en que el RBD del virus COVID-19 está optimizado para unirse al receptor ACE humano (el receptor de la angiotensina/ enzima convertidora) con una unión específica al receptor 

Si se hubiera producido una manipulación genética, se tendría que haber usado algunos de los sistemas  de RT (reverso transcriptasa)  disponibles para los beta coronavirus.

Se propones tres mecanismos que permitan extrapolar el origen de COVID-19 ó SARS-CoV-2.

1) Selección natural en animales (serpientes, murciélagos, pangolines), antes de la transmisión zoonótica.

2) Selección natural en humanos, después de haberse producido la zoonosis.

3) Selección a través de paso  inter especies ( esta es para conspiranoicos, aviso)

1.1 Los primeros casos fueron descritos en el Mercado  Huanan de Wuhan.

1.2 Dada la similitud estructural del  COVID-19 ó SARS-CoV-2 con los murciélagos (Rhinolophus affinis) se ha pensado en éste animal como reservorio. El  RaTG13, de éstos animales  tenía  un 96 % de afinidad ( en otros estudios un 98%) con el  SARS-CoV-2,  pero su proteína S ( sinónimo :proteína spike) difiere bastante del RBD ( Receptor Binding Dominio) , por lo que  ésta discordancia nos sugiere que no se podría unir eficientemente al receptor ACE ( Angiotensina/ Enzima Convertidora). 

1.3 El pangolín  (Manis javanica) se importa ilegalmente a China, concretamente a la provincial de Guangdong  y tienen coronavirus similares al SARS-CoV-22, y hay una similitud sobre el RBD similar, especialmente seis residuos  que le hacen mucho más probable que se pueda unir más eficientemente al receptor ACE2 humano de la células epiteliales de pulmón.

1.4 Ninguno de ellos tiene lo que se llama PCS (“polybasic cleavage sites”).  Ningún coronavirus de origen animal se ha identificado con la similitud suficiente como para saber exactamente de donde procede ésta enfermedad y más estudios serán necesarios para avalar con resultados éstas primeras hipótesis. Existen sin duda alguna más coronavirus que no han sido todavía estudiados, procedentes de otros vectores animales.  Pueden existir mutaciones, inserciones y delecciones de bases  que ocurran junto a dos regiones  llamadas S1 y S2 (en otros trabajos le llaman configuración “up” y “Down”). 

1.5 Se estima que los PCB aparecen por un proceso de “evolución natural”. Los autores disertan luego de la gran cantidad de contactos ó interacciones que se pueden dar cada año en China por su afición a comer “de todo” y divagan acerca de la existencia de un gen que codifique cambios en el receptor humano de ACE2. 

2. Esta teoría establece que habría existido un “salto” a la especie humana, adquiriendo los rasgos genómicos descritos anteriormente. La existencia en pangolín de una región RBD muy similar a la humana podría haber hecho que la enfermedad pasara a los humanos. 

All SARS-CoV-2 genomes sequenced so far have the genomic features described above and are thus derived from a common ancestor that had them too. The presence in pangolins of an RBD very similar to that of SARS-CoV-2 means that we can infer this was also probably in the virus that jumped to humans. This leaves the insertion of polybasic cleavage site to occur during human-to-human transmission.

Este escenario basa sus premisas en la adquisición de esas PCS (“polybasic cleavage site”) en el período de finales de noviembre 2019 hasta principios de Diciembre de 2019, como postulan autores como 23. E indican que estudios genéticos sobre muestras humanas que hayan sido guardadas pueden, a posteriori darnos una respuesta a ésta hipótesis, así como  estudios  serológicos retrospectivos sobre pequeñas exposiciones previas  de corta duración en otras regiones de China, como dicen  Wang, N. et al. Virol. Sin. 33, 104–107 (2018) 

3.  Lo que los anglosajones llaman muy concretamente “Selection during passage”, que sería la más tremenda: una fuga de un laboratorio “biosafety level 2 laboratories across the world “de forma involuntaria, dicen los autores (“inadvertent laboratory release of SARS-CoV-2”). Ge, X.-Y. et al. Nature 503, 535–538 (2013) y Lim, P. L. et al. N. Engl. J. Med. 350, 1740–1745 (2004).

Cabe pues esa posibilidad de que el SARS-CoV-2 hubiera adquirido esas mutaciones sobre el RBD  por recombinación o mutación.  

Los autores , reculan luego de esta peligrosa y preocupante posibilidad diciendo que la presencia de PCS (“polybasic cleavage site”)  y abundantes glicanos (“ predicted O-linked glycans”)   estaría en contra de ésta teoría de la dispersión involuntaria desde un laboratorio ya que generación de COVID-19 ( ó SARS-CoV-2, es el mismo virus) mediante cultivo o sucesivos pases en células animales habría requerido el aislamiento previo de un virus con muy alta similitud genética de receptores humanos ACE2  , lo que no se ha descrito.  

Personalmente no nos quedamos del todo convencidos, pero a falta de no poder probarse, pues nos olvidamos de la teoría conspirativa, hasta que alguien pueda probarla fehacientemente y sin duda alguna.

Antimaláricos para el COVID-19.

Cloroquina e Hidroxicloroquina para tratar el COVID-19.

En el Ensayo Clínico  que inicia la OMS en varios países , como un subapartado en  la rama de cinco subdivisiones de dicho ensayo, tenemos a dos fármacos  ya viejos conocidos por su actividad anti malárica y contra la artritis reumatoide.

Se  citan en TV  los compuestos Cloroquina e Hidroxicloroquina sobre el cual no hay todavia  estudios serios , se lee en internet que  esos compuesto  producen

 a) Cambios en el pH  intracelular,  como dicen algunos pseudocientíficos  que  " de alguna manera" ., cambian el ph  (¿?) .

No puede ser esta  aseveración mas "acientífica"

b) "Se dice" que  actúan sobre los receptores Cd 147, ( citometría de flujo). Sin ningún trabajos serio que lo confirme.
 Hoy sale los primeros resultados  de Hidroxicloroquina ( pre-print en Science)    y son desscorazonadores, no parece servir para mucho. Habrá que esperar a los resultados del Ensayo Clínico "Solidarity" de  la OMS.



 Esto es una simple prueba de que basta  con que   "alguien" ( en el caso  de la Cloroquina e Huidroxicloroquina, el presidente Trump, lo diga en público para que, automáticamente, se generen unas  catastróficas consecuencias.  Se agota en farmacias, se muere gente por sus efectos cardiotóxicos ( aumwnto del QT corregido a mas de 440 ms) ó  lesiones en retina ( maculopatía en  "ojod e buey").

 La posología de estos fármacos está directamente proporcional al peso corporal y será por prescripción médica. Son derivados de la 4-aminoquinoléina, con actividad antimalárica. Podrían bloquear al virus por su unión al Cd 147.

Cuando  periodistas o políticos  se meten a aprendices de brujo, cuidado, que no son   inocuos dan cardiotoxicidad  ( que puede evitarse si se hace un electro previo y su QT corregido es menor que 440 milisegundos). Si se asocian a otros medicamentos como la Azitromizina, que también aumentan el QTc , hay peligro de producir  "torsade de pointes". También producen  lesiones en retina ( la llamada maculopatía en ojo de buey). 

 Son medicamentos de prescripción médica.
Los pre print de  ensayos clíncios no están dando buenos resultados.

 Cuidado con la automedicación o con acaparar  el fármaco, que es necesario en uso hospitalario.

 Además ,en el ensayo clínico se emplea también en un estudio de Marsella la Azitromizina, un antibiótico macrólido que  TAMBIEN aumenta el intervalo QT corregido.

 Puede valer, pero cuidado. Los individuos  del estudio  son todavía muy pocos   ( n=6) y hay que aumentar el número de   pacientes. Aumentando (n), disminuimos el error alfa.

Genoma del COVID-19 y sus extrapolaciones clínicas.

Genoma del COVID-19 y sus extrapolaciones clínicas.

Se inicia la carrera por conseguir la ansiada vacuna contra el Covid19.

En los EEUU de América está el Ensayo Clíncio Fase I de una vacuna experimental con ácido RNA mensajero ( mRNA) que redirige al organismo a crear una proteína  que está en la superficie externa del Covid19 favoreciendo una respuesta inmune frente al virus.

El ensayo está dirigido por el NIH, y en concreto  se realiza en Seattle, estado de Washington en el Kaiser Institute y se realiza con 45 sujetos de entre 18 y 55 años.

 La empresa de biotecnología es Moderna Inc. , de Cambridge, Mass. Y el coordinador final es el NIAAD, con el Dr. Fauci.

 La unión de la "proteína  spike" al receptor ACE ( angiotensina/ enzima convertidora) , presente en las células epiteliales del pulmón parace ser que es el receptor mediante el COVID-19 penetra en nuestro organismo. 

 Se  ha especulado  acerca de que el COVID19 se uniria con una gran afinidad  a los receptores ACE ( Angiotensina / enzima convertidora).  Esto explicaría quizás porqué  los hipertensos son más susceptibles a la acción patógena del virus, ya que las células epiteliales del pulmon tienen una densidad mayor de éstos receptores. 

Y también  explicaría porqué en los niños, donde este sistema receptor ACE/2 no está muy desarrollado por debajo de los 16 años, el virus al parecer tienen  menos afinidad y hay menos casos. 

 De ahí que los enfermos hipertensos  sean más sensibles, al parecer y con las naturales reservas, a la acción dañina del virus.

. Ha habido "sólamente"  una muerte en niños, en China. Y - lo decimos con las naturales reservas- que los niños  en principio se afectan menos por el virus.

 Fig 1. Sistema ACE. 

En China, la científica Chen Wei, que es una médico militar con el empleo de general de División ,  lidera un estudio que  va a empezar a probarse  en voluntarios sanos.A Wei se la conoce como " la liquidadora del  Ébola". 

En todo caso, la vacuna  no va a estar disponible antes de bastantes meses ( entre 12 y 18 meses) y no será útil para  resistir el embate de ésta primera oleada del COVID19.

 En la Figura 2 ,  se reflejan  las características de la proteína "spike" que está en la  superficie del COVID19 y otros seis coronavirus. Está en rojo en la parte de arriba. Desde los 21.900 nucleótidos hasta  los 25.500 nucleótidos.

Otra peculiaridad del COVID19 es que hay un receptor llamado RRAR en la intersección de las dos subunidades de la proteína spike llamados S1 y S2  que permiten una rotura enzimaica (cleavage) por una molécula de furina y otras proteasas, que estarían relacionado con la infectividad del virus.

Al parecer, a nivel molecular hay una  molécula del aminoácido prolina insertada   en la secuencia PRRA y el cambio de conformación creado por ésta molécula   permitiría la adicción de  varios glicanos, concretamente S673, T678 y  S686.

 Para conocer más sobre los coronavirus habrá que estudiar que función tienen esas  roturas inducidas por polibases ( PCS= Polybasic Cleavage Sites), porque  no se han observado en otros coronavirus  del tipo  HKNU, mucho menos infecciosos. 

Igualmente se desconoce que función real tienen esas  (PCS)  Los experimentos  realizados para conocer la patogenicidad de éstos virus se han centrado en la inserción de  una furina en los dominios S1 y S2. que permiten  infectar a las células humanas  por  MERS o coronavirus  presentes en los murciélagos.

Se ha comprobado que  la replicación rápida de ésas PCS en una proteína llamada Hemaglutinina  (muy relacionada con la infectividad de los virus)  que  tendría una función similar a la proteína  spike.

En concreto sabemos que insertar esos dominios PCS hace que la infectividad de ésos virus aumente sustancialmente.  

Se ha postulado la teoría de que el  COVID19 venía de un salto interespecies y un aumento de esas PCS. 

El vector intermedio no está aún perfectamente claro, se habló de murciélagos (Rhinolophus affinis) , de serpientes y del pangolín (Manis javanica) .

En murciélagos el  RaTG13 tiene una similaridad genómica del  96 % y éstos animales  podrian ser reservorios del virus o de , en general, los  virus SARS-CoV-like v, pero su RBD en la proteína spike difiere por lo que no podría unirse bien al citado receptor de la ACE ( Angiotensina /Enzima Convertidora).

Los pangolines de Malasia son importados ilegalmente a  China /Guangdong  y se han descrito coronavirus de la familia SARS-CoV-2 con   una fuerte similaridad  con la RBD, en concreto a seis resíduos  aminoacídicos. 

Esto induce a pensar que  la  proteína del  SARS-CoV-2 estária muy  optimizada su síntesis iseñados  para unirse al receptor ACE  ( angiotensina, Enzima Convertidora) y serian el resultado de la selección natural .

Diversos autores , como  los científicos Zhou, P. et al. ( los primeros en publicar un caso de  COVID!9 en un paciente de 42 años en China ( Ver  Nature https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7 (2020), y Wu, F. et  están  en  contra de que el COVID-19 sea un producto de laboratorio y se inclinan mas por la selección natural.

Las secuencias que aparecen están en Banco de Datos del NCBI Gen Bank; MN908947, MN996532, AY278741, KY417146 y  MK211376. 

Las secuencias del pangolin, por consenso son:  SRR10168377  SRR10168378 (NCBI BioProject PRJNA573298)29,30

El artículo  fuente/ original  :DOIhttps://doi.org/10.1038/s41591-020-0820-9

CRISPR Cas9, un descubrimiento ESPAÑOL. Vale la pena invertir en I + D.

 En un Mundo cada vez mas enloquecido con  "ésto" del Coronavirus, la aparición de noticias como  ésta hace que uno vuelva a tener confianza y optimismo en la Humanidad.

 Se ha tratado ya  pro vez primera un caso de ceguera con  la terapoéutica Cas9 CRISPR.
Este  acrónimo corresponde a Cluster Repeat Intersegmentary Short Palindromic Repeat, tradúzcando como hace el profesor José Antonio Lozano Teruel, una de las cabezas mejor amuebladas de la regiónd e Murcia, junto con el Dr. Luna Maldonado o el Dr. Parrilla. Se podría  traducir como    fragmentos palindrómicos cortos intersegmentarios agrupados y repetitivos."Ma o menos", como dicen en la Huerta de Murcia.



 Lo diremos de otra forma: hay unos mecanismos por los cuales las bacterias se  "defienden" de los virus que las atacan. Este mecanismo  fué estudiado por vez primera por un científico español concretamente alicantino de  56 años, el prof Martínez Mógica.

 El estudió - y  sigue haciendolo- la aparición de éstas extrañas agrupaciones de DNA intercaladas en el genoma de las bacterias de las salinas de santa pola. Su trabajo es la base de casi 12.000 publicaciones posteriores que siguen la  senda de poder "editar" en un  apasionante ejercicio de " corta y pega"  los genes.

 Esto podría ser una nueva revolución en la terapia Génica. Poder tratar enfermedades  genética,  suprimiendo genes defectuosos ( como el  por ejemplo el gen que codifica el receptor CCR5, en la superficie de la célula del linfocito, lo  que sería  un paso  muy importante  en la lucha   genética contra el SIDA)  ó contra el cáncer.

 Pero las cosas no son tan sencillas en  investigación básica. por ejemplo, en el caso concretod e la supresión del receptor CCR5, eso haría que los linfocitos  fuesen menos eficaces para combatir otros virus, por ejemplo el ortomixovirus de la gripe común. O podría ser que no todas las células tuviesen  efectiva y realmente  la edición de ése gen perfectamente hechas.   Hay un gran trayecto entre los brillantes  experimentos e hipótesis plausibles y que luego realmente en la Clínica funcione correctamente.

 El que escribe éstas líneas estuvo trabajando ,en 1994,  con los  nucleótidos antis entido en el farmakologiska Institutionen de Noerte europa, pero el 90 por cientod e los experimentos no salían como se había planeado. No es tan sencillo.

 El premio Nóbel sueco Arvid Karlsson, a quien quien éstoe scribe saludó en el buffet del Instituto en  Goteborg, lleva de3sde 1960 trabajando en Dopamina, y sigue siendo humilde (  inhe tapinós artropi) y sigue  reconociendo lo poquito que conocemos sobre Ciencia.

  Resumen  para los que sepan inglés.



A person with a rare genetic condition that causes blindness has become the first to have a CRISPR–Cas9 gene therapy administered directly into their body. No treatment is currently available for the disease, which is a leading cause of blindness in childhood. The use of CRISPR–Cas9 in the body is a significant advance from treating cells in a dish. “It is akin to space flight versus a regular plane trip,” says geneticist Fyodor Urnov.