Genoma del COVID-19 y sus extrapolaciones clínicas.
Se inicia la carrera por conseguir la ansiada vacuna contra el Covid19.
En los EEUU de América está el Ensayo Clíncio Fase I de una vacuna experimental con ácido RNA mensajero ( mRNA) que redirige al organismo a crear una proteína que está en la superficie externa del Covid19 favoreciendo una respuesta inmune frente al virus.
El ensayo está dirigido por el NIH, y en concreto se realiza en Seattle, estado de Washington en el Kaiser Institute y se realiza con 45 sujetos de entre 18 y 55 años.
La empresa de biotecnología es Moderna Inc. , de Cambridge, Mass. Y el coordinador final es el NIAAD, con el Dr. Fauci.
La unión de la "proteína spike" al receptor ACE ( angiotensina/ enzima convertidora) , presente en las células epiteliales del pulmón parace ser que es el receptor mediante el COVID-19 penetra en nuestro organismo.
Se ha especulado acerca de que el COVID19 se uniria con una gran afinidad a los receptores ACE ( Angiotensina / enzima convertidora). Esto explicaría quizás porqué los hipertensos son más susceptibles a la acción patógena del virus, ya que las células epiteliales del pulmon tienen una densidad mayor de éstos receptores.
Y también explicaría porqué en los niños, donde este sistema receptor ACE/2 no está muy desarrollado por debajo de los 16 años, el virus al parecer tienen menos afinidad y hay menos casos.
De ahí que los enfermos hipertensos sean más sensibles, al parecer y con las naturales reservas, a la acción dañina del virus.
. Ha habido "sólamente" una muerte en niños, en China. Y - lo decimos con las naturales reservas- que los niños en principio se afectan menos por el virus.
Fig 1. Sistema ACE.
En China, la científica Chen Wei, que es una médico militar con el empleo de general de División , lidera un estudio que va a empezar a probarse en voluntarios sanos.A Wei se la conoce como " la liquidadora del Ébola".
En todo caso, la vacuna no va a estar disponible antes de bastantes meses ( entre 12 y 18 meses) y no será útil para resistir el embate de ésta primera oleada del COVID19.
En la Figura 2 , se reflejan las características de la proteína "spike" que está en la superficie del COVID19 y otros seis coronavirus. Está en rojo en la parte de arriba. Desde los 21.900 nucleótidos hasta los 25.500 nucleótidos.
Otra peculiaridad del COVID19 es que hay un receptor llamado RRAR en la intersección de las dos subunidades de la proteína spike llamados S1 y S2 que permiten una rotura enzimaica (cleavage) por una molécula de furina y otras proteasas, que estarían relacionado con la infectividad del virus.
Al parecer, a nivel molecular hay una molécula del aminoácido prolina insertada en la secuencia PRRA y el cambio de conformación creado por ésta molécula permitiría la adicción de varios glicanos, concretamente S673, T678 y S686.
Para conocer más sobre los coronavirus habrá que estudiar que función tienen esas roturas inducidas por polibases ( PCS= Polybasic Cleavage Sites), porque no se han observado en otros coronavirus del tipo HKNU, mucho menos infecciosos.
Igualmente se desconoce que función real tienen esas (PCS) Los experimentos realizados para conocer la patogenicidad de éstos virus se han centrado en la inserción de una furina en los dominios S1 y S2. que permiten infectar a las células humanas por MERS o coronavirus presentes en los murciélagos.
Se ha comprobado que la replicación rápida de ésas PCS en una proteína llamada Hemaglutinina (muy relacionada con la infectividad de los virus) que tendría una función similar a la proteína spike.
En concreto sabemos que insertar esos dominios PCS hace que la infectividad de ésos virus aumente sustancialmente.
Se ha postulado la teoría de que el COVID19 venía de un salto interespecies y un aumento de esas PCS.
El vector intermedio no está aún perfectamente claro, se habló de murciélagos (Rhinolophus affinis) , de serpientes y del pangolín (Manis javanica) .
En murciélagos el RaTG13 tiene una similaridad genómica del 96 % y éstos animales podrian ser reservorios del virus o de , en general, los virus SARS-CoV-like v, pero su RBD en la proteína spike difiere por lo que no podría unirse bien al citado receptor de la ACE ( Angiotensina /Enzima Convertidora).
Los pangolines de Malasia son importados ilegalmente a China /Guangdong y se han descrito coronavirus de la familia SARS-CoV-2 con una fuerte similaridad con la RBD, en concreto a seis resíduos aminoacídicos.
Esto induce a pensar que la proteína del SARS-CoV-2 estária muy optimizada su síntesis iseñados para unirse al receptor ACE ( angiotensina, Enzima Convertidora) y serian el resultado de la selección natural .
Diversos autores , como los científicos Zhou, P. et al. ( los primeros en publicar un caso de COVID!9 en un paciente de 42 años en China ( Ver Nature https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7 (2020), y Wu, F. et están en contra de que el COVID-19 sea un producto de laboratorio y se inclinan mas por la selección natural.
Las secuencias que aparecen están en Banco de Datos del NCBI Gen Bank; MN908947, MN996532, AY278741, KY417146 y MK211376.
Las secuencias del pangolin, por consenso son: SRR10168377 SRR10168378 (NCBI BioProject PRJNA573298)29,30
El artículo fuente/ original :DOIhttps://doi.org/10.1038/s41591-020-0820-9
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