La Proteína E de la superficie del SARS-CoV 2, como diana de nuevos fármacos anti virales.

Para Amelia.

Sobre la superficies del virus hay 28 proteínas, una muy poco conocida es la proteína E ( de envoltura). Escuantitativamente poco importante y todavía conocemos poco de ella. Ya hemps indicado que la mayoría de los esfuerzos para luchar contra esta `pandemia van encaminadps hacia ala proeteina S. puesto que es con la q ue se produce el anclaje del virus al receptor predominante , el ACE 2 humana ( pero tambien hay otros receptores, los de la neuropilina, que serían resondables de las coagulopatías que produce el virus. La proteína S del virus podría ser la tumba de muchas vacunas, me temo, porque el virus obedece un axioma que comparten todos los virus RNA: muta. Esta necesidad de adaptación debido a sus errores en el la enzima RNA polimerasa hace que que aarezcan mutacuones. Algunas ya bastante conocidas y otras que aun no sabemos el alcance que van a tener. Habrá que esperar- El concepto "cepa" ( "strain") va unido a cambios en la funcionalidad, Mejor hablar de variantes, , producidas por errores en el procesos de polimerizacion. Filogeneticamente, los virus RNA existían antes que la especie humana-. No es un virus que mute mucho, si o comparamos con lso ortomixovirus pero muta y prueba de ello es la nueva variante, llamada B 1.1.7 , VOC ( variable of concern) o VUI ( " variable under investigation").Tienen una proof reading deficiente y por lo tanto cambia o muta dos posiciones al mes, aproximadamente. En España las secuenciaciones las hacen varis laboratorios, un de ellos es el FISABIO , de Valencia. A lo mejor sería más interesante " tenr un plan B2", por si fallan las va cunas MRNA, cuyto target es la Spike proteína. Les propongo dos, sólo de forma heurística: Amilorida y Amilorida hexametilamina. Ocupan zonas hidrofóbicas en aminoácidos fuertemente hidrofóbicos como la fenil alanina o valina y actuarían como ionóforos, interrumiendo o dificultando el transporte de cationes al inerior del virus. Esta proteína viral E (pdb id 5x29) está en la superficie del virus y es bastante enigmática , ya estaba en el SARS CoV1 de 2003. No tenemos su estructura, tan sólo su secuenciación, y con tecnicas de VR Modeling & Docking podemos ver como algunos fármacos podrían blo uear el paso de iones. Es tecnologia utiliza realidad virtual (VR) y el llamado SWISS MODEL. Las licencias de realidad virtual las lleva Nanome Inc, con científicos españoles como Daniel Grufat. Con esta tecnología pueden calcular distancias interatómicas, fuerza de los puentes de hidrógeno ) cuanto más fuertes sean los puentes de hidrógeno más estables serán las unjones del fármaco al receptor enclavado en ésos huecos o recovecos hidrófobos. Otro concepto que conviene desarrollar es como de fuertes son la uniones de puentes di sulfuro entre entre la proteina E y la proteína S. Ya que se ha postulado que están relaccinados con la infectividad del virus. Todo esto nos valdría para diseñar nuevos y mejores fármacos antivirles.y diseñar nuevod fármacos que se unan a esos "pockets" o resíduos hidrofóbicos en la estructura de la proteína. Se ha comprobado que cuanto más fuerte es la unión al receptor, más eficaz será el fármaco. Korolkovas: Química Farmacéutica.