No la llamen CEPA, es una VARIANTE.

Figura 1:Las nueve mutaciones DE LA MAL LLAMADA "CEPA" están en rojo.

 La famosa " cepa  británica", en realidad una VARIANTE.

Hace dos meses apareció una  variante que se denominó D614G, supuestamente mas infetica del virus pandémico . En realidad el hype media que ha aparecido  estuvo completamente injustificado, pues no se ha confirmado que esa varianate fuese mas letal.

Malo cuando son los medios de comunicación quienes dan las noticias científicas y  la pandemia la combaten con criterios  políticos en vez de criterios científicos.

Esta vez el famoso locutor vendemotos de Manesia 3, Matías Cañete, apaga  la tele y vete, dió la noticia de "esa cepa británica tan peligrosa". FALSO.

 En realidad , no es una cepa , sino una  VARIANTE.  llamada de forma provisional como VUI 202012/01 (Variant Under Investigation, year 2020, month 12, variant 01).

PROSOJI: El concepto "cepa" implica cambios en la funcionalidad del virus. 

En la  VUI202012/01  hay   nueve mutaciones en la espícula, entre las que destacan N501Y en el RBD  ó  dominio de unión al receptor, y P681H justo al lado del sitio de escisión por la furina.

Las "furin cleavage site" están  fuertemente relaccionadas con la respuesta inmune innata.

Furins are ancestrally involved in the innate immune response. For instance, a preprint on a furin-cleaved polypeptide of fruit flies that encodes antifungals produced upon infection: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.11.23.394148v2 Furin cleavage is best known to act at RXRR or RXKR polybasic sites. The Sars-CoV2 site is RRAR, whereas MERS-CoV has RXVR if I recall correctly... so there are certainly alternate motifs that are likely cleaved, but these are less understood. Good review by Braun and Sauter (2019) on the whole furin-like family of humans and their cleavage: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6682551/ Furins act probably at the cell membrane or perhaps during trafficking to the cell membrane, and also perhaps at the golgi. Actually kind of unclear, and maybe all three are true. There are a number of cell entry dynamics driven by furin enzymes, including Sars2, HPV, and even anthrax toxin (ref below) gets cleaved by furin upon cell entry. I think we're at the point to know "yes, this is important." But I don't think we're at a point where we can look at a furin site (and surrounding residues) and predict much. I know it was mentioned on TWIV way back that the Proline residue ahead of the furin site is known to interfere with enzyme cleavage efficiency; I think it sticks out in a way that gets in the way of the enzyme a bit. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6347675/

Otras mutaciones que presenta son A570D, D614G, P681H, T716I, S982A y las deleciones H69–V70 e Y144. 

La histeria de los medios diciendo que " puede ser que las vacunas se vean afectadas" no está justificada.Personalmente creo que  no van a tener  efectos significativos. 

La variante británica VUI 202012/01 (también llamada B.1.1.7) presenta 29 sustituciones de nucleótidos y 14 sustituciones de aminoácidos en la proteína espicular respecto al genoma de referencia del SARS-CoV-2 (el secuanciado el 10 de Enero del 2020) .

 La espícula de este coronavirus está mutando a un ritmo de dos mutaciones al mes; así, se espera que las nuevas variantes presenten unas 22 sustituciones de nucleótidos en lugar de 29; no se sabe por qué la nueva variante VUI 202012/01 presenta más mutaciones de las esperadas . La  deleción H69–V70 ya se observó en granjas de mustélidos en Dinamarca  ; en visones también se identificó la mutación N501T (pero no la N501Y).

La mutación N501Y se detectó en  Sudáfrica, y también presenta la mutación D614G, pero que no tiene nada que ver con la variante británica (el resto de sus mutaciones son diferentes, de hecho pertenece al clado 20C ).

Todos los genomas del SARS-CoV2 se actualizan en nextstrain.com.

FUENTES:https://doi.org/10.1016/j.isci.2020.101642

     Ignacio López-Goñi, «La nueva variante “inglesa” de SARS-CoV-2», MicroBIOblog, 21 dic 2020. 

    Jacqui Wise, «Covid-19: New coronavirus variant is identified in UK,» the BMJ 371: m4857 (16 Dec 2020), doi: https://doi.org/10.1136/bmj.m4857. 

Steven Kemp, William Harvey, …, Ravindra K Gupta, «Recurrent emergence and transmission of a SARS-CoV-2 Spike deletion ΔH69/V70,» bioRxiv preprint 422555 (21 Dec 2020), doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.14.422555

      Kui K Chan, Timothy JC Tan, …, Erik Procko, «An engineered decoy receptor for SARS-CoV-2 broadly binds protein S sequence variants,» bioRxiv preprint 344622 (21 Dec 2020),

doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.18.344622.

y MUY ESPECIALMENTE  AQUÍ: